Zgodnie z art. 106j ust. 1 pkt 5 ustawy z 11.3.2004 r. o podatku od towarów i usług (t.j. Dz.U. z 2025 r. poz. 775; dalej: VATU), w przypadku gdy po wystawieniu faktury stwierdzono pomyłkę w jakiejkolwiek pozycji faktury, podatnik wystawia fakturę korygującą. Zasada ta nie zmienia się także w związku z KSeF. Korekty wystawia się w przypadku w zasadzie każdego błędu w fakturze, w tym w zakresie danych nabywcy. W KSeF są one newralgiczne, z zasady decydują bowiem o tym czy dany podmiot otrzyma fakturę, czy niekoniecznie. Ale nie zawsze, bo adresatów faktur może być wielu. To zasługa magicznej sekcji Podmiot3. Wypełnianie tego pola sprawia jednak trudności. Często jest to pole pomijane przez podatników albo realizowane nieprawidłowo, bez konsekwencji w zakresie skutecznej wysyłki faktury. Sposób korygowania ewentualnych błędów w tym zakresie także nie jest szczególnie doprecyzowany.
Dyrektor KIS wydał już dotyczącą tego zagadnienia interpretację indywidualną. Jednak praktyka nie pozostawiła na niej suchej nitki, także i na naszych łamach krytycznie ocenialiśmy przedstawioną argumentację o uwarunkowaniach systemowych. Tym bardziej ciekawe jest to, że ten sam Dyrektor KIS sięgnął niedawno po bardzo rzadko stosowaną instytucję zmiany wydanej interpretacji z urzędu, pod wpływem argumentów przedstawionych przez podatnika w skardze do WSA. Historia ta zyskała więc drugie życie, przypomnijmy więc ją sobie pokrótce.
Czego dotyczy sprawa?
Podatnik dokonuje sprzedaży na rzecz jednostek budżetowych i zakładów budżetowych jednostki samorządu terytorialnego. Gdy sprzedaż następuje na rzecz innej jednostki samorządu terytorialnego, oprócz wskazania nabywcy (czyli nazwy i NIP-u danej JST, pod którym działa ona jako podatnik VAT), wskazywany jest również „Odbiorca”. A jest nim jednostka organizacyjna JST będącej nabywcą, w ramach której działalności dokonywany jest dany zakup. Choć nabywcą jest dana gmina, odbiorcą może być przykładowo szkoła podstawowa czy gminny ośrodek pomocy społecznej. Podatnikowi zdarzają się jednak pomyłki. Niektóre z nich mogą dotyczyć NIP podmiotu trzeciego (czyli jednostki budżetowej JST). Podatnik chciał wiedzieć jak takie błędy korygować w przypadkach, gdy na fakturze pierwotnej zostanie wykazany wprawdzie prawidłowy nabywca i jego NIP (jako podatnika VAT), ale w odniesieniu do jednostki odbierającej tj. jednostki organizacyjnej JST wykazywanej jako podmiot trzeci zostanie podana błędna nazwa lub NIP (albo zarówno nazwa jak i NIP).
Dyrektor KIS wydając interpretację indywidualną z 11.2.2026 r., 0113-KDIPT1-3.4012.1091.2025.1.JM, uznał, że skorygowanie wyżej wymienionego błędu powinno nastąpić – w myśl art. 106j ust. 1 pkt 5 VATU, poprzez wystawienie faktury korygującej, zawierającej dane określone w art. 106j ust. 2 VATU, w szczególności wskazującej jako przyczynę korekty błędne określenie danych w polu Podmiot3 oraz prawidłową treść korygowanych pozycji, czyli prawidłowe dane podmiotu trzeciego innego niż nabywca wymieniony związany z fakturą. Aby jednak skorygować błąd związany z wystawieniem faktury na podmiot związany z fakturą z jego błędnymi bądź niepełnymi danymi, należy wystawić fakturę korygującą do zera oraz nową fakturę z poprawnymi danymi tego podmiotu. I tu padło kluczowe zdanie: taki proceder jest konieczny ze względu na uwarunkowania systemowe. W efekcie, fakturę korygującą trzeba rozliczyć wstecznie.
Nowe stanowisko organu
Ale to już było. Dyrektor KIS zmienił zdanie. Uznał bowiem, że w sytuacji podania błędnych/niepełnych danych dotyczących jednostki organizacyjnej jednostki samorządu terytorialnego, skorygowanie błędu powinno nastąpić poprzez wystawienie faktury korygującej, wskazującej jako przyczynę korekty błędne określenie danych w polu Podmiot3 oraz prawidłową treść korygowanych pozycji, czyli prawidłowe dane podmiotu trzeciego związanego z fakturą, innego niż sprzedawca (Podmiot1) i nabywca (Podmiot2). Tym samym, korygowanie pierwotnie wystawionej faktury sprzedaży z powodu wskazania na niej błędnych/niepełnych danych faktycznego odbiorcy towarów i usług, tj. jednostki organizacyjnej JST wykazywanej jako podmiot trzeci, powinno nastąpić poprzez wystawienie faktury korygującej błędne/niepełne dane.
W sytuacji gdy faktura została wystawiona na właściwego nabywcę, to wystawienie faktury korygującej „do zera” jest niezasadne. Ma to swoje konsekwencje także w rozliczeniu „na osi czasu”, choć nie jest to określenie najbardziej adekwatne.
Oto bowiem złożony przez podatnika korygujący plik JPK VAT z deklaracją podatkową zastępuje pierwotny (korygowany) plik JPK VAT z deklaracją podatkową i pociąga za sobą skutki prawne, pozbawiając jednocześnie pierwotny plik JPK VAT z deklaracją podatkową mocy prawnej. Korekta JPK VAT z deklaracją podatkową ma na celu poprawienie błędu, który został popełniony przy jego sporządzeniu. Może on dotyczyć określenia wysokości zobowiązania podatkowego, wysokości nadpłaty lub zwrotu podatku oraz innych danych zawartych w treści tego pliku. Skorygowanie pliku JPK VAT z deklaracją podatkową polega na ponownym, poprawnym jego wypełnieniu. W rozpatrywanej sprawie nie wystąpi sytuacja, w której należy skorygować dane Podmiotu2, zatem nie ma obowiązku wykazywania faktury korygującej z prawidłowymi danymi Podmiotu3 w plikach JPK VAT.
Komentarz
Dlaczego omawiana interpretacja w swoich obydwu ogłoszonych postaciach tak bardzo spodobała się w publicystyce podatkowej? Cóż, ta pierwsza wersja była problematyczna dlatego, że przez lata Dyrektor KIS konsekwentnie w kwestii zerowania faktur twierdził, że trudności techniczne prawidłowego rozliczenia podatku VAT mają charakter drugorzędny i nie mogą wpływać na kwestie podatkowe. Nie można bowiem interpretować przepisów prawa podatkowego przez pryzmat udogodnień sfery techniczno-organizacyjnej, jakie niesie ze sobą w praktyce stosowanie określonej normy prawnej (interpretacja indywidualna Dyrektora KIS z 2.2.2022 r., 0111-KDIB3-1.4012.942.2021.1.KO, Legalis). A tu się okazało, że trudności techniczne i uwarunkowania systemowe jednak mogą wpływać na kwestie podatkowe. O ile oczywiście są to uwarunkowania systemowe po stronie organów podatkowych, a nie podatników.
Ta druga wersja też nie jest idealna. Przyjęcie nowego podejścia Dyrektora KIS to cios w podmioty trzecie, które realnie nie mają szans otrzymania faktur pierwotnych (przynajmniej w KSeF), ponieważ te przecież nigdy do nich nie dotrą w systemie (skoro NIP się nie zgadza).
Na uwagę zasługuje także inny wniosek z tej odświeżonej interpretacji wypływający. Mianowicie, Dyrektor KIS potwierdza, że korekta fakultatywnych pól faktur w zasadzie go aż tak bardzo nie interesuje. To znaczy, jeśli jest potrzeba skorygowania faktury w jakimś mało istotnym elemencie, to oczywiście można to zrobić. Ale nie trzeba tego w żaden sposób wykazywać w deklaracji VAT. To ważne, bo takich błędów podatnicy popełniają mnóstwo. I często korygują je poprzez wyzerowanie faktury. Sztampowy przykład to numer zamówienia (purchase order, PO). Błąd w tym polu nie ma żadnego znaczenia podatkowego, ale kontrahent często odmawia zapłaty jeśli numer nie będzie poprawnie wskazany. Podatnicy więc zerują takie w pełni poprawne faktury, co poprawne nie jest. Jeśli więc podatniku, w węźle „Opis Ładunku” zamiast „2 beczka” wskazałeś omyłkowo „9 Łubianka”, to choć łubianka jest błędem – nie musisz tej korekty rozliczać w JPK V7.
Interpretacja indywidualna Dyrektora KIS z 11.2.2026 r., 0113-KDIPT1-3.4012.1091.2025.1.JM
Artykuł pochodzi z Systemu Legalis. Bądź na bieżąco, polub nas na Facebooku →
